Нарушение и восстановление микробиома носа после лечения мупироцином у носителей и неносителей Staphylococcus aureus
Научные отчеты, том 12, Номер статьи: 19738 (2022) Цитировать эту статью
1148 Доступов
10 Альтметрика
Подробности о метриках
Процедуры назальной деколонизации против условно-патогенного микроорганизма Staphylococcus aureus основаны на местном применении противомикробных препаратов, влияние которых на назальную микробиоту плохо изучено. Мы исследовали это влияние на здоровых носителях и неносителях S. aureus. Это проспективное интервенционное когортное исследование с участием 8 носителей S. aureus и 8 неносителей, получавших назальные ванны с мупироцином и хлоргексидином. Последовательные мазки из носа брали в течение 6 месяцев. S. aureus был обнаружен количественным культуральным методом и генотипирован с использованием спа-типирования. Метабаркодирование на видовом уровне 16S на основе РНК использовалось для оценки разнообразия живых микроорганизмов. Виды Dolosigranulum pigrum, Moraxella nonliquefaciens и Corynebacterium propinquum отрицательно коррелировали с носительством S. aureus. Лечение мупироцином эффективно уничтожало S. aureus, D. pigrum и M.nonliquefaciens, но не коринебактерии. Реколонизация S. aureus у носителей происходила быстрее, чем реколонизация доминирующим видом у неносителей (в среднем 3 и 6 месяцев соответственно). Большинство повторно колонизирующихся изолятов S. aureus имели тот же спа-тип, что и исходный изолят. Влияние лечения мупироцином-хлоргексидином на микробиоту носа все еще можно было обнаружить через 6 месяцев. Реколонизация S. aureus предшествовала восстановлению микробиоты, что подчеркивает сильную адаптацию этого патогена к носовой нише и временную эффективность процедуры деколонизации.
Золотистый стафилококк является условно-патогенным микроорганизмом и частой причиной тяжелых инфекций. Примерно 20% населения в целом являются постоянными носителями S. aureus, а еще 30% являются интермиттирующими носителями1. S. aureus обычно переносится в носу и реже в горле, коже и промежности1.
Носители золотистого стафилококка подвергаются более высокому риску заражения после инвазивных процедур и хирургических вмешательств2,3. Чтобы предотвратить инфекции, несколько стран рекомендуют удалить S. aureus из носа до вмешательства в группу риска, используя процедуру деколонизации4. Обычно это включает местное противомикробное лечение с использованием назальной мази мупироцина с хлоргексидином для мытья кожи и волос или без него. Различные подходы к деколонизации возникли из-за затрат и организационных проблем в здравоохранении5. В то время как некоторые советуют лечить всех пациентов, подвергающихся вмешательствам из группы риска, другие ограничивают деколонизацию только подтвержденными носителями.
Хотя мы знаем, что состав назального микробиома связан с присутствием S. aureus6,7, влияние процедур деколонизации на назальную микробиоту еще не до конца изучено. В предыдущих исследованиях назального микробиома носительство S. aureus было связано с более высокой относительной численностью Cutibacterium Acnes, Corynebacterium Accolens и стафилококков, не относящихся к aureus, а также с более низкой численностью Corynebacterium pseudodiphtheriticum, Dolosigranulum spp. и Cutibacterium granulosum6,7. Эти ассоциации позволяют предположить, что распределение видов микробов в носу влияет на персистенцию S. aureus, возможно, за счет конкуренции за питательные вещества и участки связывания с эпителием8. В свою очередь, изменение микробного распределения после процедуры деколонизации может повлиять на вероятность стойкой реколонизации S. aureus и, с клинической точки зрения, на неудачу деколонизации. Однако масштабы и продолжительность изменений микробиоты после деколонизации не выяснены. На данный момент исследование микробиома у одного пациента выявило изменения в составе и биоразнообразии назальной микробиоты после лечения мупироцином9, в отличие от предыдущего исследования культуромики с участием 5 здоровых добровольцев, в котором не было обнаружено существенных изменений богатства и разнообразия микробиоты в течение 1 месяца. после деколонизации10.
Чтобы расшифровать взаимосвязь между назальным носительством S. aureus, назальной микробиотой и процедурами деколонизации, мы провели проспективное интервенционное когортное исследование носителей и неносителей S. aureus, отслеживая изменения микробного сообщества в течение 6 месяцев после лечения мупироцином-хлоргексидином. Используя количественные культуры и метабаркодирование 16S, мы изучили влияние деколонизации на бактериальные сообщества и задержку повторной колонизации S. aureus и другими доминирующими видами.